Melatonin ist ein Aminhormon, das hauptsächlich von der Zirbeldrüse von Säugetieren und Menschen produziert wird. Die menschliche Zirbeldrüse ist ein körniges Bohnengewebe, das an der hinteren Wand des dritten Ventrikels befestigt ist. Es wurde auch berichtet, dass die Netzhaut und die akzessorischen Tränendrüsen von Säugetieren ebenfalls eine geringe Menge Melatonin produzieren können; Melatonin kann auch in den Augen, im Gehirn und in der Haut einiger thermophiler Tiere (z. B. Frösche) und einiger Algen synthetisiert werden.